投標保函辦理手續費（銀行保函）得根據辦理方式來定，如果企業自己去銀行辦理，交全額保證金，然后按照季度交手續費，大概在幾百塊不等，還有一種方式是通過占用第三方擔保公司在銀行的額度出的保函（分離式保函），這種保函跟企業自己去出保函效果一樣，出的保函上不體現擔保公司，只體現受益人、申請企業、項目名稱、保函金額和期限等信息，這種費用也是幾百塊，但是不用交保證金。
二、占用擔保公司在銀行的額度出保函
（1）提供的資料僅僅只有：招標文件電子版、營業執照電子版。
（2）擔保公司根據招標文件要求，做保函的格式，然后給申請企業確認。
（3）格式沒問題，交手續費（幾百塊）給到擔保公司。
（4）擔保公司提交銀行，等著出保函，快的話，當天就出保函，慢的話，隔天出保函。
商業保函指的是，除了銀行以外，由其他商業機構出具的保函，一般出具保函的公司都是專業的擔保機構或商業機構的信用擔保。
商業保函也是包括了很多種的，比如預付款保、農民工工資支付保函、質量保函、投標保函、履約保函等，這些都是屬于商業保函。
商業保函的費用相對于銀行辦函要便宜很多，有的可能低于50%以上。這對于建筑企業來說，相對還是比較節約成本的。
履約保證金和違約金的區別：
違約金是指按照當事人的約定或者法律直接規定，當一方當事人違反合同時，應當向另一方當事人支付的金錢。違約金與履約保證金都具有督促債務人履行合同的作用。二者的區別在于：首先，違約金是合同一方違約時承擔責任的一種方式，具有補償性和懲罰性。而履約保證金為合同履行的一種擔保方式，是否具備補償性和懲罰性，法律法規沒有明確規定，通說認為其具有補償性；其次，違約金適用于合同雙方當事人，而履約保證金通常只約束一方當事人即中標人，當接受履約保證金的招標人違約時，履約保證金對其不起作用；第三，違約金一般無需預付，在債務不履行損害發生后始得請求，而履約保證金則應根據合同約定交納。