投標保函等于投標保證金，一般投標的時候，都會讓投標的企業交投標保證金，但是這個錢得真金白銀交給招標代理公司或者招標人，一個公司運轉，誰也不想資金被占用，那么讓擔保機構（銀行、保險公司、擔保公司）來做擔保出一個憑證，就可以不用交錢了。
投標保函辦理手續費（銀行保函）得根據辦理方式來定，如果企業自己去銀行辦理，交全額保證金，然后按照季度交手續費，大概在幾百塊不等，還有一種方式是通過占用第三方擔保公司在銀行的額度出的保函（分離式保函），這種保函跟企業自己去出保函效果一樣，出的保函上不體現擔保公司，只體現受益人、申請企業、項目名稱、保函金額和期限等信息，這種費用也是幾百塊，但是不用交保證金。
商業保函與銀行保函有什么區別？
1、信用不同：銀行保函是由銀行直接出具的，屬于銀行信用，而商業保函是由專業的擔保機構或商業機構出具的，屬于商業信用。
2、用途不同：銀行保函多用于國際貿易，國內會比較少，屬于國際擔保業務，而商業保函多用于國內國家。
3、商業保函相對于銀行保函要簡單上許多，其不需要準備太多的資料，而且辦理速度快，費用也比較低。
4、商業保函的格式條款相對于會靈活一些，而銀行保函的格式就會比較嚴謹，不能隨意更改。
履約保證金和違約金的區別：
違約金是指按照當事人的約定或者法律直接規定，當一方當事人違反合同時，應當向另一方當事人支付的金錢。違約金與履約保證金都具有督促債務人履行合同的作用。二者的區別在于：首先，違約金是合同一方違約時承擔責任的一種方式，具有補償性和懲罰性。而履約保證金為合同履行的一種擔保方式，是否具備補償性和懲罰性，法律法規沒有明確規定，通說認為其具有補償性；其次，違約金適用于合同雙方當事人，而履約保證金通常只約束一方當事人即中標人，當接受履約保證金的招標人違約時，履約保證金對其不起作用；第三，違約金一般無需預付，在債務不履行損害發生后始得請求，而履約保證金則應根據合同約定交納。