中國醫學科學院阜外醫院始建于1956年，是一所集醫療、科研、預防和人才培養于一體的三級甲等專科醫院，是北京市醫保定點單位。
2021年8月，中國醫學科學院阜外醫院實驗診斷中心被評選為第20屆全國青年文明號。
2021年11月20日，入選2020年度中國醫院綜合排行榜。2021年12月3日，門頭溝區政府與中國醫學科學院阜外醫院簽署戰略合作框架協議，共同推動首批國家醫學中心阜外西山院區落地門頭溝。
中國醫學科學院阜外醫院（以下簡稱阜外醫院），是三級甲等心血管病專科醫院，目前正朝向綜合型醫院轉型發展。阜外醫院是國家心血管病中心所在地，是心血管疾病國家重點實驗室、國家心血管疾病臨床醫學研究中心建設承擔單位，是獲得全國首批“輔導類”國家醫學中心和全國國家醫學中心實質落地項目建設單位，以診治各種復雜、疑難和重癥心血管疾病而享譽國內外，已成為世界上的心血管疾病診治中心和集醫療、科研、預防和人才培養于一體的醫學研究與教育中心。
阜外醫院始建于1956年，2009年中央編辦批復成立國家心血管病中心，正式形成“中心—醫院”一體化格局。本部阜成門院區總用地規模5.53萬平方米，總建筑面積15.7萬平方米；門頭溝西山院區總用地規模7.33萬平方米，其中西山一期建筑面積3.7萬平方米；西山二期項目建設正在加速推進，建筑面積5.62萬平方米。
加強心血管防治新體系建設
阜外醫院始終以“心血管病高危人群早期篩查與綜合干預項目”“國家基層高血壓管理防治管理項目”“三高（高血壓、高血糖、高脂血癥）共管項目”“中國居民心血管病及其危險因素監測項目”四大國家項目為媒介，提升基層衛生服務能力。
心血管病高危人群早期篩查與綜合干預項目自2014年啟動，十年間累計篩查社區居民超過524.7萬人次，檢出心血管病高危對象146.4萬人，并完成風險監測干預隨訪465.7萬人次。