把保函與跟單信用證相比，當事人的權利和義務基本相同，所不同的是跟單信用證要求受益人提交的單據是包括運輸單據在內的商業單據，而保函要求的單據實際上是受益人出具的關于委托人違約的聲明或證明。這一區別，使兩者適用范圍有了很大的不同，保函可適用于各種經濟交易中，為契約的一方向另一方提供擔保。另外，如果委托人沒有違約，保函的擔保人就不必為承擔賠償責任而付款。而信用證的開證行則必須先行付款。
投標保函：
主要用于國際投標與招標業務，通常是招標人要求投標人參加投標的條件之一。銀行(擔保人)應投標人(申請人)的申請，開立的以招標人為受益人的保函，保證投標人在開標之前不中途撤銷投標、不片面修改投標條件或中標后不拒絕簽約、不拒絕交納履行保證金或提供銀行的履約保函，否則銀行將支付給招標人一定的金額作為賠償。其目的在于表明投標人的誠意與資格。
借款保函：
我行接受借款方的請求，向貸款方出具保函，如借款方不按期向貸款方償還借款本息，我行將根據貸款方的索賠，按照保函約定承擔付款責任。
還款保函又稱預付款保函或定金保函。是指擔保人應合同一方當事人的申請，向合同另一方當事人開立的保函。保函規定，如申請人不履行他與受益人訂立合同的義務，不將受益人預付或支付的款項退還或還款給受益人，擔保人向受益人退還或支付款項。
除上述兩種保函外，還可根據其他功能和用途的不同，分為其他種類的保函，如：投標保函、補償貿易保函、來料加工保函、技術引進保函、維修保函、融資租賃保函、借款保函等等。