辦理食品經營許可證有如下步驟：
1、取得個體工商戶營業執照。辦理健康證和知識培訓合格證，一般可以去醫院或者當地防疫站辦，帶上營業執照副本、公章和身份證去。去醫院體檢后，一般2-3個工作日健康證和知識培訓合格證就可以出來了。
2、準備食品經營許可證申請表，可以向當地市場監督管理局咨詢地址。
3、準備法人身份證復印件、從業人員身份證復印件和健康證。然后制定食品管理制度（一般當地市場監督管理局都有模板）。
4、繪制店鋪的平面圖。提交繳納稅費單據證明，證實你所使用的水是自來水公司提供的。
5、把這些資料全部準備好后，去當地市場監督管理局提交（有的地方在政務大廳就可以辦理）。
6、資料提交成功之后，市場監督管理局會安排人員來看場地。一般要求為：進貨渠道方有相應的合規資質，店內衛生、使用原料和柜要符合標準。
7、檢查合規之后一般15-20個工作日食品經營許可證就出來了，很多地方都會打電話通知去領取。