分離式保函：
是指銀行、保險公司、擔保公司或擔保人應申請人(一般為擔保公司)的請求，為被擔保人(主合同的一方)向受益人開立的一種書面信用擔保憑證，保證在被保證人未能按雙方協議履行其責任或義務時，由擔保人代其向受益人履行一定金額、一定時限范圍內的某種支付或經濟賠償責任
差額保函：
為防止投標人低價搶標，招標文件會設置一個風險控制價(一般為招標上限價的85%，亦有例外，具體看招標文件規定)，凡低于該風險控制價的，中標人在提交履約保證金的同時必須額外提交中標價與風險控制價之間的差額擔保，可以用保證金的方式，亦可用保函的方式，用保函方式提交的，該保函即為差額保函(風險控制價-中標價=差額)。一般差額保函金額超過中標價的20%，風險較大，原則上不予辦理。
預付保函又稱還款保函及退款保函，在貿易合同中還可以成為定金保函。在大額交易中，買方或業主在合約簽訂后的一定時間內預先需向供貨方支付一定比例的款項作為執行合同的啟動資金，由于該款項是對供貨方在履約之前所作的預付，買方為了避免日后由于供貨方拒絕履行義務或者無法履行義務，卻不退款而無端遭到損失，通常要求供貨方在買方預付之前的若干日內通過其銀行開出預付保函，有銀行作出承諾，一旦申請人未能履約或者是無法全部履約(不管這種行為是有意的或者是無意造成的)，擔保行將在收到買方提出的索賠后，向其返還這筆與預付金額等值的款項，或者相當于合約尚未履行部分相當比例的預付金額，使買方能夠順利的收回所預付的款項。
預付款保函與履約保函的區別：
履約保函是為了保證中標單位如約履行工程合同的內容
預付款保函是保證在甲方支付了預付款之后能收到合同約定的效果，也即在甲方支付了預付款之后如乙方沒有履行合同，銀行則將預付款保函的相應押金交還給甲方作為損失補償。
也就是說這是兩個不同的保函，都是要交的。因此從某一個角度也能體現施工單位的經濟實力。
不過不用擔心，作為預付款的保函既然是為了保證預付款的，就不像履約保函那樣一定要到工程全部建設結束，合同內容履行完畢之后才退還給你。通常是約定保證預付款用在合同上就可以退還了。只是在工程建設前期凍結在銀行，后面就解凍了。