同仁醫院歷經百余年發展，凝練出“精誠勤和”的醫院精神。在新的歷史時期，同仁人將繼承和發揚百年同仁優良傳統，弘揚主流文化，苦練內功，精于內涵，團結一致，創新發展，努力為人民群眾提供優質、、快捷的醫療服務。
醫院設有眼底科、青光眼科、眼外傷科、白內障中心、視光中心、眼角膜科、眼腫瘤科、眼肌科、眼中醫科、眼整形科、臨床檢查中心、中心防盲辦公室、同仁眼庫、北京市眼科研究所、耳科、鼻科、喉科、頭頸外科、中心防聾辦公室、北京市耳鼻咽喉科研究所、變態反應科、心內科、心外科、神經內科、消化內科、呼吸內科、腎內科、內分泌科、血液科、風濕免疫科、感染科等科室。
其中眼科、耳鼻咽喉科為原衛生部批準的國家臨床重點專科，變態反應科為國家衛生和計劃生育委員會批準的國家臨床重點?？?，中醫眼科學為國家中醫藥管理局批準的中醫重點學科。
青光眼科的臨床診療技術長期居于國內水平，接近國際水平，這是我們多年來的特色，也是在學術界常年保持水平的重要基礎。以惡性青光眼的診斷和為代表，在難治性青光眼的診斷和方面，始終處于國內水平，這方面的研究成果先后獲得北京市科技進步二等獎和三等獎;在許多青光眼診斷技術的應用方面，青光眼科都走在國內同行的前列，比如應用二極管激光睫狀體光凝技術各種難治性青光眼，應用激光小粱成型術早期開角型青光眼和殘余性青光眼，青光眼白內障的聯合手術，非穿通小粱切除手術，引流植入物手術、粘小管成型術、小梁消融術、全周小梁切開術先天性青光眼等。
在青光眼診斷技術和方法方面，我們擁有許多先進設備：3D頻域OCT、海德堡視網膜斷層掃描儀(HRT)、GDx視網膜神經纖維厚度測量儀、自動視野計、多焦VEP、眼底立體照相、全景超聲生物顯微鏡(UBM)、前節OCT、鞏膜上靜脈壓測量儀、回彈式眼壓計、超聲角膜測厚儀、YAG激光機、SLT激光機等各類青光眼診療設備二十余臺，先進程度與國際醫院保持同步?？蓪η喙庋巯嚓P各項生理指標進行客觀、定量的測量。自2009年設立了24小時眼壓監測室，能夠對青光眼患者眼壓變化做出更加準確、的評價。
