醫院擁有5位中國工程院院士，1百多名技術三級以上專家，1千多名高職專業技術人員。醫院先后獲得省部級以上科技成果獎勵1300余項，其中，國家科技進步一等獎7項，二等獎20項，國家發明獎2項，軍隊科技進步一等獎21項。 [2]
2017年11月11日下午，復旦大學醫院管理研究所正式發布了《2016年度中國醫院排行榜》和《2016年度中國醫院專科聲譽排行榜》，中國人民解放軍總醫院名列第三。
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國家骨科與運動康復臨床醫學研究中心由國家科技部、衛健委、軍委后勤保障部和國家藥監局于2019年5月正式批復成立，是目前國內骨科與運動康復領域的臨床醫學研究中心。中心依托單位為中國人民解放軍總醫院，承載著強化醫學科技創新體系建設、打造國家臨床醫學和轉化研究“新高地”的重要使命與任務，始終堅持以臨床需求為牽引、以轉化應用為導向、以創新網絡為支撐的工作思路，著力構建全生命周期的創新生態平臺，開展臨床研究、協同創新、成果轉化、推廣應用、學術交流、人才培養等工作。中心目前已開展臨床研究39項，發表論文600余篇，授權國際專利13項、國家專利120余項。牽頭/參與國內指南、共識40余項，開展線上/線下教育，培訓人員340余萬人次。開展千余次遠程會診、扶貧幫帶，賦能地方醫療機構骨科診療能力。
