苗期管理苗期應經常觀察苗地情況，遇旱及時澆水，保持苗床濕潤，雨季注意排水，防止積水。種子苗在小苗長至2～3對真葉時要及時進行間苗，按株距5厘米留苗。苗期除草2～3 次，施肥2 次～3 次，以薄施氮肥為主。每公頃每次施腐熟農家水肥15000 kg或尿素150kg兌水淋施。一年生苗株高達15厘米，莖粗達0.2厘米以上可以出圃。
林下管理
每年除草2～3次。每年結合中耕除草進行追肥1～2次，追肥以有機肥為主，用量約300kg/公頃，及時清除覆蓋住苗木的枯枝落葉。
傳統的采收方法以采收全株為主，藥典所載也是以全株藥用，草珊瑚野生分布地多為肥沃疏松的土壤，且根系淺，易于連根拔起，這種采集方法對草珊瑚藥材資源是毀滅性的，是不可持續的。在人工栽培條件下，如采用采收全株的方法，也會大大增加種植年限和種植成本，而獲得的產量并無明顯增加。一般草珊瑚藥材根部重量約占全株重量的10%左右，如果采收植株地上部分，雖然產量稍低，但每年都有收成，又能降低生產成本，達到可持續生產的目的。
在人工栽培條件下，應在種植3年后采收藥材為好，草珊瑚藥材有效成分異嗪皮啶含量在9月和10月較高，因此草珊瑚藥材采收時間在每年的9月～11月份較適宜。在廣西的自然條件下，9月～11月氣候相對比較干燥，降雨少，植株的水分含量相對較低，此時開展藥材采收工作，也有利于藥材的干燥保存，方便運輸。草珊瑚藥材采收后在干凈的曬場上曬干，有條件的也可進行烘干，即可作為原料藥材出售。
草珊瑚剛從野生轉為家種，抗病蟲能力較強，目前尚未發現為害較重的病蟲害，無需防治。但如果田間遮蔭條件差、在陽光強烈的夏季，會出現葉片灼傷現象，葉尖或葉綠出現斑枯，嚴重的全葉枯焦。可采用灌水降溫、改善遮蔭條件等措施，以減輕為害。