水母型的體壁結構與水螅型基本相似，也是由兩層上皮肌肉細胞中間夾有中膠層構成，但水母型的中膠層遠較水螅型發達。體壁圍繞的胃循環腔也較發達，它或是一個簡單的囊，或是被膜分隔成4個胃囊，由胃囊向傘緣伸出4條（水螅綱水母）或更多的（缽水母）輻射管，并與傘緣平行的環管相連，由環管也可伸出離心的小管進入觸手，直達觸手末端。在傘緣或觸手基部有感覺器官，例如眼點或平衡囊。
生活史的主要階段是單體、水母型，其水螅型階段不發達、或完全消失。缽水母綱的水母體不同于水螅綱的水母體，這種區別主要表現在：缽水母綱的水母體一般體型較大，沒有緣膜；胃循環腔復雜，輻射管發達，有內胚層起源的胃絲，胃絲上有刺細胞；中膠層中有外胚層起源的細胞及纖維；生殖細胞起源于內胚層，水螅綱水母均來源于外胚層；神經感官較發達，集中形成4-8個感覺器官。
不同的水母有不同的形態，水母身體的主要成分是水，其體內含水量一般可達98%以上，并由內外兩胚層所組成，兩層間有一個很厚的中膠層，不但透明，而且有漂浮作用。其他則是蛋白質和脂質所構成，所以水母的身體呈現透明狀。它們沒有心臟、血液、鰓和骨骼。普通水母的傘狀體不很大，只有20-30厘米長。它們在運動之時，利用體內噴水反射前進，就好像一頂圓傘在水中迅速漂游。
有些水母不單顏色多變，而且還會在水中發光，有些閃耀著微弱的淡綠色或藍紫色光芒，有的還帶有彩虹般的光暈，當它們在海中游動時，就變成了一個光彩奪目的彩球。水母發光靠的是一種叫埃奎明的奇妙的蛋白質，這種蛋白質和鈣離子混合時，就會發出強藍光。埃奎明的量在水母體內越多，發的光就越強，每只水母平均只含有50微克。