不同的水母有不同的形態(tài)，水母身體的主要成分是水，其體內(nèi)含水量一般可達(dá)98%以上，并由內(nèi)外兩胚層所組成，兩層間有一個(gè)很厚的中膠層，不但透明，而且有漂浮作用。其他則是蛋白質(zhì)和脂質(zhì)所構(gòu)成，所以水母的身體呈現(xiàn)透明狀。它們沒有心臟、血液、鰓和骨骼。普通水母的傘狀體不很大，只有20-30厘米長(zhǎng)。它們?cè)谶\(yùn)動(dòng)之時(shí)，利用體內(nèi)噴水反射前進(jìn)，就好像一頂圓傘在水中迅速漂游。
有些水母不單顏色多變，而且還會(huì)在水中發(fā)光，有些閃耀著微弱的淡綠色或藍(lán)紫色光芒，有的還帶有彩虹般的光暈，當(dāng)它們?cè)诤Ｖ杏蝿?dòng)時(shí)，就變成了一個(gè)光彩奪目的彩球。水母發(fā)光靠的是一種叫埃奎明的奇妙的蛋白質(zhì)，這種蛋白質(zhì)和鈣離子混合時(shí)，就會(huì)發(fā)出強(qiáng)藍(lán)光。埃奎明的量在水母體內(nèi)越多，發(fā)的光就越強(qiáng)，每只水母平均只含有50微克。
缽水母綱的水母體體型較大，傘緣直徑一般在2-40厘米之間，個(gè)別大的種直徑可達(dá)1-2米，例如一種霞水母。傘呈圓盤形，如海月水母，或呈錐形、半圓形、蝶形等因種而異。由于體內(nèi)的生殖腺或其他胃囊等結(jié)構(gòu)具有色澤，而使身體在透明中出現(xiàn)局部的粉紅色、桔紅色等。
缽水母類的神經(jīng)結(jié)構(gòu)也是由外胚層形成的神經(jīng)網(wǎng)，也具有突觸傳導(dǎo)。原始的種類例如立方水母類（Cubomedusae），也像水螅水母一樣，在傘緣具有兩個(gè)神經(jīng)環(huán)。但多數(shù)的缽水母類已不存在這種傘緣神經(jīng)環(huán)，而是神經(jīng)細(xì)胞集中，形成4個(gè)或8個(gè)神經(jīng)節(jié)分布在傘緣的觸手囊中。顯然，其中含有起博點(diǎn)神經(jīng)元，因?yàn)槿绻腥ト康纳窠?jīng)節(jié)，水母則失去博動(dòng)的能力，如果切去部分神經(jīng)節(jié)，甚至只留一個(gè)神經(jīng)節(jié)，水母仍能做有節(jié)奏的收縮運(yùn)動(dòng)。所以神經(jīng)節(jié)中含有起博點(diǎn)神經(jīng)元，它控制著水母類的肌肉收縮運(yùn)動(dòng)。