甲醛的主要危害表現為對皮膚粘膜的刺激作用。甲醛在室內達到一定濃度時，人就有不適感。大于0.08 mg/m3的甲醛濃度可引起眼紅、眼癢、咽喉不適或疼痛、聲音嘶啞、噴嚏、胸悶、氣喘、皮炎等。新裝修的房間甲醛含量較高，是眾多疾病的主要誘因。
致癌性：
IARC的致癌性評論曾為“動物陽性；人類不明確”，后經過進一步研究，在2006年確定為1類致癌物（即對人類及動物均致癌——"sufficient evidence of carcinogenicity"）。
研究動物發現，大鼠暴露于每立方米15μg甲醛的環境中11個月，可致鼻癌。美囯囯家癌癥研究所2009年5月12日公布的一項研究成果顯示，頻繁接觸甲醛的化工廠工人死于血癌、淋巴癌等癌癥的幾率比接觸甲醛機會較少的工人高很多。研究人員調查了2.5萬名生產甲醛和甲醛樹脂的化工廠工人，結果發現，工人中接觸甲醛機會最多者比機會最少者的死亡率高37%。研究人員分析，長期接觸甲醛增大了患上霍奇金淋巴瘤、多發性骨髓瘤、骨髓性白血病等特殊癌癥的幾率。
食品中的甲醛
甲醛為國家明文規定的禁止在食品中使用的添加劑，在食品中不得檢出，但不少食品中都不同程度檢出了甲醛的存在。⑴存在于水發食品中。由于甲醛可以保持水發食品表面色澤光亮，可以增加韌性和脆感，改善口感，還可以防腐，如果用它來浸泡海產品，可以固定海鮮形態，保持魚類色澤。因此，甲醛已經被不法商販廣泛用于泡發各種水產品中。市場上已經檢出甲醛的水發食品主要有：鴨掌、牛百葉、蝦仁、海參、魚肚、鯧魚、章魚、墨魚、帶魚、魷魚頭、蹄筋、海蟄、田螺肉、墨魚仔等，其中蝦仁、海參和魷魚中的甲醛含量較高。⑵存在于面食、蘑菇或豆制品中。甲醛可以增白，改變色澤，故甲醛常被不法商販用來熏蒸或直接加入到面食、蘑菇或豆制品中，不法商販用“吊白塊”熏蒸有關食品增白時，也可以在食品中殘留甲醛。已經檢出甲醛的有關食品有：香菇、花菇、米粉、粉絲、腐竹等。
品紅一亞硫酸法
品紅一亞硫酸法指利用甲醛與品紅一亞硫酸在濃硫酸存在條件下呈藍紫色的特性，用比色定量進行檢測的方法。本法利用的是甲醛的特有反應，其它醛與酚不干擾測定。此法操作簡便、測定范圍寬，但其比色液很不穩定，重現性較差，在測定甲醛含量較低的樣品時，差異較大，度不如乙酰丙酮法，而且品紅一亞硫酸法受溫度影響較大，檢測過程還需濃硫酸，故一般多用于食品中甲醛的定性分析。