甲醛的主要危害表現為對皮膚粘膜的刺激作用。甲醛在室內達到一定濃度時，人就有不適感。大于0.08 mg/m3的甲醛濃度可引起眼紅、眼癢、咽喉不適或疼痛、聲音嘶啞、噴嚏、胸悶、氣喘、皮炎等。新裝修的房間甲醛含量較高，是眾多疾病的主要誘因。
急性毒性：
LD??：800mg/kg（大鼠經口），2700mg/kg（兔經皮）；LC??：590mg/m3（大鼠吸入）。
人吸入60～120mg/m3，發生、肺部嚴重損害。
人吸入12～24mg/m3，鼻、咽黏膜嚴重灼傷、流淚、咳嗽；人經口10～20mL，致死。
甲醛濃度過高會引起急性中毒，表現為咽喉燒灼痛、呼吸困難、肺水腫、過敏性紫癜、過敏性皮炎、肝轉氨酶升高、黃疸等。
致突變性：
微生物致突變：鼠傷寒沙門氏菌4mg/L。哺乳動物體細胞突變：人淋巴細胞130 μmol/L。姊妹染色體交換：人淋巴細胞37pph。
2010來發現，甲醛能引起哺乳動物細胞核的基因突變、染色體損傷、八斷裂。甲醛與其他多環芳烴有聯合作用，如與苯并芘的聯合作用會使毒性增強。
AHMT法
AHMT法指甲醛與AHMT（4-氨基-3-聯氨-5-巰基-1，2，4-三氮雜茂）在堿性條件下縮合，經高碘酸鉀氧化成紫紅色化合物，然后比色定量檢測甲醛含量的方法。AHMT法在室溫下就能顯色，且SO、NO共存時不于擾測定，靈敏度比比色法要好。該方法特異性和選擇性均較好，在大量乙醛、丙醛、丁醛、苯乙醛等醛類物質共存時不干擾測定，檢出限為0.04 mg/L。但AHMT法在操作過程中顯色隨時間逐漸加深，標準溶液的顯色反應和樣品溶液的顯色反應時間必須嚴格統一，重現性較差，不易操作，多用于居室中對甲醛的檢測。其檢測技術要求如下所示：
檢測原理：堿性溶液中與AHMT發生反應，經高碘酸鉀氧化成紅色化合物，半定量地快速檢測液體樣品中人為加入的甲醛含量。該方法優點是抗干擾能力強，缺點是顏色隨時間逐漸加深，要求標準比色卡顯色標注時間和樣品溶液的顯色反應時間必須嚴格統一。