工程審計是指審計機構依據國家的法令和財務制度、企業的經營方針、管理標準和規章制度，對工程項目的工作，用科學的方法和程序進行審核檢查，判斷其是否合法、合理和有效，以期發現錯誤、糾正弊端、防止舞弊、改善管理，保證工程項目目標順利實現的活動。工程審計獨立于項目組織之外，審計人員與項目組織無任何直接的行政或經濟關系。
工程審計是依據國家《審計法》等相關規定，對工程概、預算在執行中是否超支，有無隱匿資金、截留基建收入和投資包干結余，以及有無以投資包干結余的名義私分基建投資的違紀行為等。審計是以基建項目為標的，以會計師、審計師為主要從業人員。