如果不定期清洗太陽能熱水器，那么它里面就會積累很多水垢。而這些水垢中含有多種化學成分，長時間過后，水中的有害物質就會不斷增加，可能會導致使用者皮膚過敏。另外，粘泥、微生物、在長時間的不斷更新與交替反應中，也會生成很多有害物質，從而引發多種皮膚病。
方法1、
將太陽能真空管拆下來，灌入適量白醋浸泡10分鐘，接著用毛刷來回拉動除掉余下的水垢，然后再用清水沖洗即可。但需要注意的是，真空管十分易碎，一定要輕拿輕放。
方法2、
如果真空管不方便拆卸，可以打開太陽能熱水器的進水口，將白醋倒入存水箱內。接著讓熱水器自動循環20-30分鐘，使白醋充分接觸各部位，然后打開排水口，排干清洗過水垢的白醋。將水箱加滿水后再次循環2分鐘，排干循環水即可。
方法3、
購買專用的太陽能除垢劑，將它與水按1:10的比例混合，配成清除液加入存水箱內。如果家里的熱水器很長時間沒有清洗，也可以直接倒入原液，浸泡5-15分鐘便能瓦解水垢了。然后讓其自動熱循環20-30分鐘，接著從排水口直接排干清洗液。打開進水口，加滿水后再循環兩分鐘，排干后就完成清洗工作了。
