工程審計包括兩大類型：工程造價審計和竣工財務決算審計
造價審計一般是對單項、單位工程的造價進行審核，其審計過程與乙方的決算編制過程基本相同，即按照工程量套定額。這由造價工程師完成。
對于建設單位來說，由于造價審計只是審核單項、單位工程的合同造價，一個建設項目的總的支出是由很多單項、單位工程組成的，而且還有很多支出比如前期開發費用、工程管理雜費等是不需要造價審計的，所以還要有一個竣工財務決算審計，就是將造價工程師審定的，和未經造價工程師審核的所有支出加在一起，審查其是否有不合理支出，是否有擠占建設成本和計劃外建設項目的現象等，來確定一個建設項目的總的造價。這由注冊會計師完成。