工程結算審計區別于工程結算審核，工程結算審核是以成本預算部門在工程竣工與施工方結算價款時進行的工程成本造價審核，以確定工程成本。工程結算也不同于工程竣工結算，他是工程竣工結算的組成部分。工程結算審計的目的是通過審核、比對、查證，對發現的送審工程終點不符合施工合同，或違反相關政策文件、現行計價取費標準及工程量計算規則的差錯，以及其他人為高予在糾正，從而有效地控制工程造價、規范工程造價管理。所以，工程結算審計一般包括以下內容：
1.審核竣工結算編制據：工程竣工報告、竣工圖及竣工驗收單；工程施工合同或施工協議；施工圖預算或招標工程合同標價；設計交底及圖紙會審記錄資料；設計變更及現場簽證；合同的規定的定額、材料預算價格、構件、成品價格等。
2.審核工程量：重點審核投資比較大的分項工程、容易混淆出漏洞的工程（如基礎工程中的土方工程）；材料用量及價差；隱蔽驗收記錄；工程定額的套用、取費；
3.審核施工企業資質及工程合同的合規性。